1、申請(qǐng)主體不同。申請(qǐng)爭(zhēng)議的人只能是在先注冊(cè)的商標(biāo)所有人，而不當(dāng)注冊(cè)商標(biāo)的撤銷請(qǐng)求人可以為被請(qǐng)求撤銷商標(biāo)注冊(cè)人之外的任何人，甚至可以直接由商標(biāo)局依職權(quán)撤銷；商標(biāo)異議的請(qǐng)求人則為任何人。 

2、適用對(duì)象不同。被爭(zhēng)議的商標(biāo)和被撤銷的商標(biāo)必須是已經(jīng)注冊(cè)的商標(biāo)，而被提出異議的商標(biāo)是初步審定并公告但尚未被核準(zhǔn)注冊(cè)的商標(biāo)；商標(biāo)異議程序是商標(biāo)被核準(zhǔn)注冊(cè)的必經(jīng)程序，但對(duì)注冊(cè)商標(biāo)爭(zhēng)議的裁定及商標(biāo)注冊(cè)無(wú)效的補(bǔ)正不是必經(jīng)程序。 

3、法定期限不同。對(duì)已經(jīng)注冊(cè)的商標(biāo)提出爭(zhēng)議的時(shí)間為自被爭(zhēng)議的注冊(cè)商標(biāo)核準(zhǔn)注冊(cè)之日起5年內(nèi)；提出商標(biāo)異議的商標(biāo)異議的時(shí)間為自該商標(biāo)初步審定并公告之日起3個(gè)月內(nèi)；提出不當(dāng)注冊(cè)商標(biāo)的補(bǔ)正請(qǐng)求時(shí)間則因不同情況而有所不同。 

4、申請(qǐng)事由不同。注冊(cè)商標(biāo)爭(zhēng)議的理由，即是在后注冊(cè)的商標(biāo)與用于同一種或類似商品上在先注冊(cè)的商標(biāo)相同或近似，其理由不能與核準(zhǔn)注冊(cè)前 已提出異議并經(jīng)裁定的事由和理由相同； 提出異議的理由是，經(jīng)商標(biāo)局初步審定并公告的商標(biāo)違反了商標(biāo)法的某一規(guī)定；撤銷注冊(cè)不當(dāng)?shù)纳虡?biāo)的理由，是該注冊(cè)商標(biāo)違反了《商標(biāo)法》第10條、第11條和第12條的規(guī)定，或者是注冊(cè)申請(qǐng)人采用了欺騙手段或者其他不正當(dāng)手段獲得注冊(cè)，以及違反商標(biāo)法第13條、第15條、第16條和第31條規(guī)定而取得注冊(cè)的商標(biāo)。 

5、受理機(jī)關(guān)不同。爭(zhēng)議必須向商標(biāo)評(píng)審委員會(huì)提出，由商標(biāo)評(píng)審委員會(huì)作出裁定；異議則應(yīng)向商標(biāo)局提出，對(duì)商標(biāo)異議的裁定不服的，當(dāng)事人可 向商標(biāo)評(píng)審委員會(huì)申請(qǐng)復(fù)審；對(duì)注冊(cè)商標(biāo)的撤銷，既可以由商標(biāo)局依職權(quán)決定，也可以由他人請(qǐng)求商標(biāo)評(píng)審委員會(huì)裁定，由商標(biāo)評(píng)審委員會(huì)作出裁定，但對(duì)于由商標(biāo) 局作出的決定，商標(biāo)注冊(cè)人還可請(qǐng)求商標(biāo)評(píng)審委員會(huì)復(fù)審。